Навскидку - попробуйте такой вариант. Выставьте все необходимые настройки (причем видео в последнюю очередь), примените и выйдете из игры. Запустите снова и посмотрите остались ли ранее установленные настройки.
Вариант 2 - вручную поправить настройки в файле data\k42\loc_rus\config\config.engcfg
проверить их работоспособность
если все работает как задумано, то можно на всякий случай сделать этот файл "только для чтения"