У меня Afterburner 2 и самодельные педали отлично уживаются (в ИЛ-2, естественно). АВ2, понятное дело, USB; педальки оформлены как отдельное устройство (две оси и одна кнопка - для калибровки) и подключаются к Game-порту звуковухи.
Насколько я слышал, с фланкером такой фокус не пройдет