Ну, насколько я понимаю, порядок действий примерно следующий ...
1. В том графическом редакторе, который нравицца (не обязательно Фотошопе ) правим ЛЮБОЙ из файлов (меняем лицо, перекрашиваем комбез, вешаем себе, любимому, пять звездочек ГСС и т. д. ).
2. Сохраняем результат в 256-цветовой палитре (в Фотошопе, поговаривают, надо выставлять "индексед колорс") под любым именем (можно заменить и какой-то из существующих - эт непринципияльно).
3. Начав кампанию, лезем в настройки самолета и в качестве скина для пилота вместо "Стандартный" выбираем именно тот файл, в котором сохранены результаты нашей, с позволения сказать, деятельности.
4. Все

З.Ы.
Просто подменить "Стандартный" скин, шоб СРАЗУ своя морда лица юзалась, по-видимому, не выйдет - он, похоже, как и "Стандартный" скин для крафта, "вшит" куда-то в движок ...

З.З.Ы.
Ну и в простом редакторе, и в он-лайн, понятноге дело, тож можна эту ж личность заюзать