Не уверен, что случай твой, но у меня был Х52, потом приобрел педали Сайтек. Ил их не воспринимал. Пришлось переустанавливать.
Но это лирика. У меня была вторая копия Ила на компе, где была таже беда. Я слазил в конф.ини и обнаружил, что там напротив кривых для педалей везде стоит -1 -1 -1 и т.д.
Поставил "всепосто" всмысле везде 100, кроме первого и последнего значений (они вроде отвечают за инвертированность и еще что-то). Ситуёвина исправилась.