как эти черные прямоугольники (альфа), будут уживаться с основной техтурой нервюры
Никак не будут. Там где есть 100% альфа-канал - там нет ничего другого, он ведь делает деталь 100% прозрачной.
Если не сложно, можешь коротЕнько пояснить как правильно нервюру "задетачить", плз?
Закладка Edit->Sub-oject "Face"->Выделить все фейсы, которые надо отделить->Detach->New Object->Задать имя новой детали.