не вижу никаких проблем для самодельных миссий. Их можно пустить отдельно.
модифицировать миссии сделанные разработчиками - не вижу смысла.
а вот по поводу добавления новых миссий, то тут как раз все карты в руки пользователям - если разрабы создадут отдельный портал для миссий пользователей и можно будет вгорячую летать миссии, созданные энтузиастами, загружая их прямо с сервера разрабов как с форума. Это очень хорошая идея! прямо в огру включенная база данных с миссиями и рейтингом. Поиск по различным ключам и возгласы игроков: "Сегодня NNN сделал пару миссий новых интересных. Загляни в его "комнату" полетай - попробуй!" И никаких отдельных скачиваний по форумам. все ждесь, под рукой!