Значит, сделана настройка кнопки пуска в игре? А если наоборот - в игре убрать маппинг гашетки пуска и сделать через профайл?

Профиль джоя точно не активен? Уж больно похоже на последовательное срабатывание от клавиатуры и джойстика. Один ли девайс, если нет - то не назначена ли гашетка и на второй (она может быть назначена и автоматически, по дефолту)?