А ошибки эти были и будут накапливаться. Но дойдя до определённого числа, если ничего не устанавливать, особо их количество не растёт.
И использовать лучше не виндоктор, а RegOrganizer -
бесплатная утилита для реестра, в том числе и ошибки правит и чистит корректно.
http://www.chemtable.com/ - адрес её. После установки прочитай файлы текстовые внутри, там порядок разблокирования написан.