Если не ошибаюсь, в !BACKUP пишется не мод, а те файлы, которые заменяются модом. Подозреваю, что она нужна для отключения модов.
Причём, эта папка общая для всех модов. То есть это могут быть файлы разных модов(в том числе и конфликтующих между собой, если такие есть) и вообще дикая мешанина.... Так что, чем больше модов и чем сильнее они пересекаются, тем бессмысленнее эта папка. В принципе её можно очищать...