Автопилот управляет самолетом триммерами. Как следствие, если вы его отключили не из сбалансированого полета, то получили разбалансированную машину со всеми вытекающими. Способы борьбы:
1. На всех самолетах, кроме Су-25 и 25Т, сбросить триммера в нейтраль.
2. На всех без исключения - сбалансировать триммерами
3. Отключать автопилот только в прямолинейном полете. Тогда ничего не надо будет делать.