Пока навскидку:
Боюсь, что так просто перенести корабли из sh4 в sh5 не удастся. У них совершенно разные движки. В sh5 Юби основную ставку сделала на мультипликацию, использовав новый движок Granny3D. Все для кораблей зашито в файлы с расширением .GR2. Модели используются Hight и Low. Вот там и надо копать. Возможно в этом поможет 3 D редактор Granny3D, но он сильно засекречен и в свободном скачивании его нет.