Это весьма плохая идея, ненужно ничего копировать вручную - это с высокой вероятностью приведет к неработоспособности.
В папке с игрой специально сделан файл updater.cmd - запускаете его - сразу попадаете в программу установки модов. И там экспериментируете.
Чтобы испортить игру так чтобы нельзя было удалить обновления, нужно приложить чрезвычайные усилия
Главное вручную ничего не копировать. И не нужно игру переустонавливать - моды специально так сделаны чтобы не затирать по возможности оригинальные файлы.
Не нужно удалять игру и не нужно вручную копировать, тогда все будет хорошо
P.S. Используйте updater.cmd для установки патчей и всяких экспериментов.