Да, диагноз вы поставили верный. Вся загвоздка именно во включенной "автоэкспозиции" в драйверах камеры. А в окне самого FreeTrack-а в закладке "camera Properties" имеются какие-либо существенные настройки (в частности, само-собой бегунок автоэкспозиции и возможность отключить ее автоматическую подстройку) или только всякие настройка яркости? На офсайте http://genius.ru/products.aspx?pnum=20464 есть драйвер для вашей камеры, возможно его установка добавит новых опций в указанном выше окне. А сторонний контент (на случай, если в окне "camera properties" пусто) можно попробовать любую прогу для работы вебкамеры, они дают доступ к настройкам камеры (если, конечно, драйвером эти самые настройки предусмотренны). Более конкретно по названиям, если надо, - завтра, а то спать уже хочу).
Ну и в конце-концов, камера уже проверенна LSA, отзыв - положительный. Так что все решаемо, не отчаивайтесь. Если нужна консультация LSA, то лучше ему в личку напишите, так вернее будет.