да. можно руками. и соответсвующей папки в соответсвующую папку.
насчет замены - все эти файлы не влияют на основной контент игры. их целиком можно удалять после использования - игра от этого не пострадает- у нее весь контент запакован и врежиме выключенных модов берется из изнутри.