прошивка в конфигуратор не встроенав окне программатора плат In** есть меню Файл, там нужно выбирать файл прошивки платы In**. Апдейт или новая плата разнесены потому что при программировании новой платы автоматом прошиваются FUSE-биты, а при апдейте программировать FUSE-биты не надо.