мегу вообще непросто спалить, хотя был у меня 1 случай, чип полностью работал, но в определенный момент перестал поддаваться прошивки, пришлось выкинуть.
попробуй установить режим free runing, и просто попробовать прочитать атмегу, установив галочки чтение FLASH и EEPROM