Теоретическая возможность несправедливости по отношению к членам семей есть - все же принцип "сына за отца не отвечает" был нарушен. Но это предположительно, "в теории".
З.Ы. Мое же личное мнение совпадает с вашим - депортации были оправданы, и более того, как показали дальнейшие события, репрессии являлись слишком мягкими и поверхностными.