Чтоб убедиться, что семерка действительно не трогает по своему усмотрению файлы, могу посоветовать переписать всю папку Ил-2 на диск D: (или на худой конец в Мои Документы).
Или, если умеешь, поставить для папки, где сейчас установлена игра, полные права для пользователя "Все" (попутно убрав все остальные записи прав).

К тому же, как я писал выше, на производительность может влиять включенное aero. Это лечится в свойствах il2fb.exe (см. мои сообщения в этой ветке).