Только интересно 3d ли эти облака? Мне показалось, что там несколько слоев и псевдо 3d: т.е. нижний слой (перистые облака) просто движущаяся параллельно земле картинка, остальные (кучевые облака) сделаны по принципу БОБа, т.е. картинками, стоящими вертикально, ориентированными на зрителя (т.е. всегда перпендикулярно взгляду зрителя, как объекты-картинки в старых играх). Для того, чтобы придать эффект появления/исчезновения облака - работает прозрачность 0-100% (обратите внимание на исчезающее маленькое облако на 0:17).