да не зашкаливает. достаточно один раз пересмотреть и не делать выводы по первому впечатлению.
большинство моментов там объясняется.

насчет рисунков и координат - нарисованной пиктограмме соотв только одна галактика. в ней ей солнце и одна планета, более менее пригодная для обитания. к ней они и летят.

экспедиция снаряжается специально для подтверждения гипотезы двух ученых-уфологов. старикан Вейланд говорит, что всегда мучался вопросами - кто мы, зачем и почему. уфологи же являются авторами идеи родства древних языков с языком инопланетян. почему именно уфологи? Вейланд всегда предпочитал фанатично верующих людей. с мотивацией героев все нормально. вся затея - прихоть престарелого миллиардера. что здесь странного?
и команда нормальная. кроме уфологов все остальные адекватны.

вся эта кутерьма начинается из-за саботажа робота - он проносит на борт заразу, инфицирует людей, не предупреждает о возможной опасности, вводит в заблуждение экипаж. в ситуации, когда в команде предатель неизбежны суматошные и нелогичные действия. не забывайте, это научное судно, а не военное.

ну и. т.д. есть вопросы - пересматривайте сами. не понравился - другое дело. но от ляпов это не зависит. их не так много, как некоторым показалось.

--- Добавлено ---

кстати, насчет Аватара, до которого Прометею якобы как до Луны... с технической, визуальной стороны Аватар прорыв. во всем остальном - типичное выяснение отношений между ковбоями и индейцами. даже в самых старых вестернах находился благородный бледнолицый, который носил пончо. имхо Кэмерон в фантастике всегда был более попсушным, чем Скотт.