После наблюдения за работой опции CO2 bug fix в течении долгого времени и в связи с тем, что поступали жалобы на ее неправильную работу выявлены причины полного прекращения роста концентрации CO2 на погруженной лодке. Их две -

- сохранение игры при погруженной лодке с последующей загрузкой этого сохранения (после загрузки концентрация СО2 обнуляется и перестает расти)
- сворачивание игры без выхода в главное меню (после выхода в главное меню игру сворачивать можно)

Все внесено в комментарии к опциям в пост #1...