В игре Ил-2 настройки делаются так :
1. в файл rcu (находится в корне игры) дописываем строку @file mycommands.cmd
2. создаем (в блокноте) файл mycommands.cmd и помещаем его в корневой каталог игры. В этом файле прописываем нужные настройки маркеров, контактов, ...
Я у себя в БоБе тоже так сделал - все работает.
А вот для серверной части был файл не mycommands.cmd а server.cmd
Надо попробовать.
Здесь предлагаю нужные файлы.