Вход/выход это понятно, как подключаются посмотрел по аналогии с распиновкой на сайте у вас. с ин64 подключил 1ю матрицу, а вот со второй - непонятки, смотрел в конфигураторе, на 1й все срабатывает, на второй- шишь. Может я все таки с распиновкой напутал?

Пы.Сы. СТОП!!! А на вход/выход все контакты (16штук) должны быть соединены? А то я мучаю разъем который от оут идет: 2х2-2х2(пустые)-2х4 контактов
Пы.Пы.Сы. распиновку использую эту http://joyctrl.ru/doku.php?id=board:matrix32_64