Если вы сейчас к примеру закроете программу и откроете её снова,затем выберите те два файла,что удачно экспортировали,это топокарта(её кусочек) и карта растра(кусочек srtm),открыв их,то они должны наложиться друг на друга.Кстати на вашем втором скрине из 727 поста,там где напротив Расширения-качества стоит число "75",я выставлял 100,незнаю влияеет ли это,но мне подумалось,что лучше пусть будет в 100% качестве.