Да, заполнять можно не весь, не забывайте про буферную зону по периметру в 1 квадратик 2х2 км (она не заполняется и никогда не будет использоваться).
Карту деталей получать также как и высот только резать не с СРТМов, а со спутниковых снимков (главное не получить при этом бан в Гугле) и 1024 пикселя на 2048 м после ресайза. Можно рисовать вручную. Точно также можно сразу нарезать топокарту.