стабилитроны работают только в рамках обвязки USB, на оси и кнопки они вообще никаким боком.
конкретно к атмеге8 и прозводных от неё схема с индкутивностью не будает работать должным образом, в чипе ошибка - внутри замкнуты питание и опорное для АЦП. другой резистор пробовал?
фотки бы платы, может визуально определим.