Винтовка как я уже сказал берется из миссии, то есть убил врага с этой винтовкой и даже если ты ее не подобрал на поле боя, он будет у тебя на базе. Пополнение берется со временем из ниоткуда, типа мана небесная так сказать
Кстати там в отличие от УФО ты представляешь не всю землю а лишь отдельный отряд, у тебя не может быть больше 1 вертолета а только он может досталвять бойцов в миссии. Зато теперь миссии которые не хочется проходить можно делегировать своим коллегам (мнопка Delegate в меню выбора миссии).
По поводу захвата базы, точное название не помню. Но общая суть предварительного захвата базы - разведка территории (смотри в тексте миссии будет написано мол для расширения территории нам нужно получше исследовать ее), второй этап - захвата собственно базы (там будет написано, что пришла пора, мы нашли чужую базу надо ее зачистить).