При переустановке настоятельно рекомендую сохранить
conf.ini
Users
Missions
Campaign
Насчет DGen и его папки- не знаю, пусть кто-нибудь точно скажет.

Файлы НьюВью тоже лучше сохранить, если его используешь

Суммарно пол-игры получилось
Кстати, возможно, я что-то упустил и желательно к списку что-то добавить.