Сам нашёл .
Если у кого-то такая же проблема то в реестре прописать:
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\ABBYY\FineReader\4.0\New User Defaults\FineReader4\Fine Objects]
"ErrorStopMode"="NEVER"
"AssertStopMode"="NEVER"

или скачать файлик StopModeFR40.zip