Да то что 90-99% - это нормально абсолютно. Надо посмотреть как ведет себя оперативка и своп, и с каким процессом совпадают тормоза(обращение к свопфайлу, увеличение дискового кэша). И все-таки попробуй 53.03, предварительно начисто снеся старые дрова.