На ATI - лучше 32bps. Не быстрее, не медленнее, просто качественнее. Они изначально рассчитывались на 32 bpp.
На GF3 - можно и то, и то. При 16bpp выиграешь от 5 до 10%. Но чуток потеряешь в качестве. Вот и решай...