Винда ХР Home c SP1a, файловая система NTFS, но с фатом такая же фигня была,
решил сегодня попробовать родной виндовсовский дефрагментатор, так он наглядно быстрее работает чем Нортоновский.

Sokill : спасибо за инфу, обязательно попробую эти проги, может и правда шустрее будет работать.