Потрогай руками радиаторы проца и видяхи, через 10-20 минут напряженной работы. У видяхи еще и память потрогай. Если что-то где-то жжет - тогда проблема.
Замени термопасту на проце и видюхе. Если старая сильно высохла - значит, проц жестоко греется.
А в случае перегрева нужно думать о модернизации системы охлаждения.

И ты уверен, что это именно только в ЗС? Играешь ли в другие мощно нагружающие комп игры так же долго?
Если нет, можно погонять 3ДМарк какой-нить. Хотя он нагружает систему меньше, чем ЗС...

И наконец, самый железный способ - найти на время какую-нить видеокарту (способную тянуть ЗС) и посмотреть, будет ли это происходить и с ней.