Мммм... Вообще-то это больше относится к топмачтовикам... В этом случае бомба ударяется в борт корабля и если не пробивает (что в случае боевого корабля весьма верояно) то падает вниз и взрывается под водой. А там и брони нет да и плюс гидродинамический удар...
У крупных надводных кораблей(ЛК, АВ, ТКр, ЛКр) обычно предусматривалась противоминная защита (ПМЗ) - обычно какое-либо чередование отсеков с нефтью и пустых отсеков(были правда случаи что кое кто були с цементом делал), такая защита была эффективна даже против корабельных торпед(около 500кг ВВ). Как достоверно реализовать эффект близкого разрыва я представляю себе слабо, да и сам этот эффект тоже был слабоват в сравнении с прямыми попаданиями , единственный(ну или самый простой) выход это введение хитпоинтов и их вычитания по хитрой формуле взависимости от мощности бомбы и дальности взрыва.

Плюс время безопастного отхода ит корабля....
гм-м, а вы представляете что такое радиовзрыватели и 40мм счетверенные бофорсы?

А воздействие на корабли (особенно на катера, охотники) пушечно-пулеметного вооружения реализовано?? О.М. вроде говорил, что будет.
Лишь бы не получился такой казус как с РСами....