1. Карты Берлина или Финского залива на серверах я не запускал.
2. С демоном версию 3.02 ещё не пробовал.
3. Файлы *.cmd у меня самые что ни на есть стандартные, единственно, строчка пароля и путь к карте там меняется.
4. Из server.cmd запускается gc.cmd. А потом он уже сам себя вызывает рекурсивно с таймаутом 3600000. А в нём три раза повторяется команда CG. Вот она, вроде, и служит для чистки памяти (буфера, кэша - Яву я не знаю, поэтому подробностями не владею).