Это называется garbage collection, то есть "сборка мустора". Такова сама по себе технология Явы... чтоб она сдохла не родившись.
У нас раньше этот оут был только на Берлине. Даже финский залив не глючил, просто тормозил. Так вот... мучились мы со сборкой мусора, ставили разные задержки, и в один прекрасный день обнаружили, что в момент сборки выскакивают баги в самом телнет-соединении (которое использовал старый демон). После отключения неожиданно пропало много странных непонятностей в нём, необъясимых (по логу то выидно оказалось - что это в момент GC появлялось). Но долго сервер без GC не живёт - память утекает вёдрами.
Пробовали ставить и чаще сборку... глюки появились даже на простых картах, типа Смоленска, пришлось оставить как есть, и меньше летать в Берлине.
Сейчас на Нулевом стоит 2.04... с ужасом ждём, что день грядущий нам приготовил.