А кварц менял? Дело в том что в незапрограмированном состоянии атмега работает от внутренего генератора, а прошив биты переключаеш ее на кварц. Все-таки попробуй какой нибудь кварц типа 4МГц.
Бывает что кварцы иногда вылетают в болшинстве от механических воздействий.

Я недавно опубликовал наиболее полную схему:
http://www.mindaugas.com/projects/MJ...matic_v1.4.pdf

Можеш попробовать доработать.