Если бы потеря самолетов при дитче имела какое-либо значение для этой войны, то их нужно было бы таки вычеркивать... хотя с другой стороны, поскольку причина данной ситуации в недоработанном геймплее, то... наверное в первую очередь нужно настоятельно просить разработчиков поправить это дело.

Вроде, должно быть несложно.
Вирпил1 - заходит на посадку,
Вирпил2 - стартует миссию.

1. Вирпил1 жмет Tab-8-4 ("запрос на посадку").
2. Сервер проверяет, есть ли самолеты на ближайшей к Вирпилу1 ВПП, и есть ли у сервера запрос от Вирпила2 на "рождение" на ВПП.
2.а Если любое из условий верно, виртуальный диспетчер отвечает "полоса занята, уходите...".
2.б Если оба условия неверны, виртуальный диспетчер отвечает "посадку разрешаю" и блокирует рождение самолета Вирпила2 на 20 секунд.

Вуаля.