После продолжительных экспериментов проблема решилась - не дружили мой SATAшный диск и контроллер nForce. Если этот диск стоял одним в системе - возникал этот глюк. Причем возникал всегда в разное время, поэтому было трудно найти что и как. Сначал обнаружил то, что все работает нормально если поставить этот диск вторым, а грузиться с IDE. Причем все было нормально до тех пор, пока не поставил драйвера nForce IDE - опять начались глюки. В итоге запретил все SATA интерфейсы nForce, а диск подключил к силиконовскому RAID контроллеру в режиме JBOD. С тех пор все грузится нормально.