Завсегда пажаласта.
1) Насчет slave/cable select - как работает, так и оставь. Нельзя починить то, что не сломано. (cable select - это установка работает с такими хитрыми шлеифами, где одна жилка выбита - типа как автоназначение устройств мастер/слэйв)
2) При подключении на один канал устройства используют один и тот шлейф для передачи данных. Дабы все не перепуталось, мы их и разделяли, одного возводя в мастеры, другого обзывая слэйвом. Так вот, сажая два харда на один шлейф, ты их немного "стесняешь". А подсадив второй хард к двд - нет. (сравни скорости передачи данных и частоту обращения к харду и к двд) Кстати, если хошь, можешь перенести файл подкачки на этот второй диск - может в некоторых случаях сильно понизить кол-во затыков винды (но необязательно).
3) По поводу переустановки. Ну - можно и переставить. Может быть, даже и нужно, от греха подальше, раз есть нарекания на старый хард. Хотя...
...4) Мои максторы тож бывают пищат под большим загрузом. Причем давно - и ничего вроде. Такк что тут - хз.