Причина шума, в первую очередь - несбалансированность, а отсюда вибрации.

Путём перебора, выбрать менее шумящий вентилятор.
Попробовать самому сбалансировать вентилятор.
Взять вентилятор с меньшими оборотами, но большим диаметром.
Компьютер поставить на звукопоглощающие прокладки (пенопласт, поролон, резина)
Обклеить, с внутренней стороны, системный блок звукопоглощающим материалом (старые коврики для мыши, например).
Подтянуть все винты в системном блоке, чтобы убрать возможные вибрации.

Кстати, можно попробовать поставить между вентилятором и радиатором, мягкие прокладки, возможно будет немного гасить вибрации, хотя через винты всё равно будет передаваться.