Если включить топливометр по схеме H-моста (двух H-мостов), и питать его ШИМ сигналом
Значит, и топливомер при USB будет дрожать. Правда, можно использовать Выборку/Хранение как ты предлагал (но ЦАП нужен), и еще внутренний аппаратный ШИМ, он есть во многих AVR, но обычно, от одного до четырех каналов
К тому же, с USB бывают и другие заморочки. (у меня, к примеру ИЛ не видит MJOY под W98, хотя сама система - видит; а под 2000 все нормально...)
В общем, ДЛЯ НАЧАЛА, полагаю все же будет проще с UART'ом.
Тем более, что "классические" порты сейчас уже мало используются, и на большинстве машин свободный СОМ найти можно.