Если глушить ГПС, то конечно ущерб будет. Гражданская авиация уже давно использует ГПС как основное средство навигации, емнип. Но даже на гражданских самолетах только на ГПС никто не полагается. В авиации вообще не принято полагаться на что-то одно, если есть возможность это продублировать.