Во-первых, в FSIUPC есть ограничение на скорость изменения погоды. Нужно проверить, чтобы погодные условия менялись не быстрее. Но эта опция (сглаживание изменений метеоусловий) доступна только в регистрированной версии.

ИМХО, ставить обновление погоды за СЕКУНДЫ не рационально. Погодные условия в реальности так не меняются, новые данные генерятся, как правило, не чаще 1 раза в 15 минут.

Скорее, стоит пользоваться программами, позволяющими генерировать погоду для заранее составленного флайт-плана. Этими функциями обладают ActiveSky или последние версии WeatherCenter.

Если вы не меняли МЕТАР, то при возвращении на точку будет загружена прежняя погода. Тот же результат будет, если вернемся достаточно быстро, пока метеоинформация не обновилась.