По поводу фракций - насколько я понял, пока тебе дают квесты в секторах той фракции с которой хочешь наладить отношения, шанс их наладить есть. Но рано или поздно тебе дадут квест который окончательно сделает тебя врагом какой-либо из группировок. Обычно это либо убийство, либо террор-миссия.