Преимущества и недостатки есть и у е-буков и у "бумажных" книг.
Например, многие справочники удобно иметь в электронном виде - если это txt, rtf, doc, html или распознаный pdf, то это даёт возможность полнотекстового поиска. Яркий пример - работы Мюллер-Гилебранта или Кривошеева.
Я стараюсь иметь многие книги и электронном и в бумажном вариантах, причём невзирая на цену.