Предполагаю свою версию...
Действительно, был перелет самолетов в Калиниградскую область, однако было так называемое "второе задание". Проверить боеготовность прибалтийских частей из-за какой-то проблемы мне не известной. В процессе полета, один самолет отделился для выполнения задания. пролетая над другой территорией он был просто и банально сбит частями ПВО.
Все остальное - прикрытие политических ведомств, не надо обострять ситуацию...