Если в Windows Alt, Shift, Ctrl + клавиша работают, идём дальше.

Отключи джойстик, если есть.
Отключи программы конфигурирования кнопок на джойстике, типа Saitek Profiler.
Проверь, изменится ли ситуация с "Alt, Shift, Ctrl + клавиша" в игре.

Если не работает, тогда:
В игре создай нового пользователя.
В раскладке клавиатуры игры сделай раскладку по-умолчанию.
Проверь, изменится ли ситуация с "Alt, Shift, Ctrl + клавиша" в игре.

Если не работает, тогда:
Выбрось компьютер с (здесь подставь на каком этаже ты живёшь)

PS. Надеюсь до последнего пункта не дойдёт