Цитата Сообщение от che
победили это так:
уболтали админа запустить всё так как есть

запустили коммандер через форсестарт как демон, создали админа в закладке админа сервера с индексом один

соответственно появилась возможность гасить и сервер и командер по terminate
а на фтп перекидываем конфиги, а демон через 30 секунд поднимает командер, а тот в свою очередь уже сервре
ну вот видишь, не быват безвыходный положений, что-нибудь да получится, если долго мучится.....