Была такая проблема.
Решено с помощью программки FlashBoot 1.3.0.126 с www.prime-expert.com
Программуська позволяет создать загрузочный флэш-диск не только на основе
системной дискеты, но и конвертировав соответствующим образом компакт-диск, например с системой Windows BartPE. Еще одна полезная функция – создание флэшки с загрузчиком Windows XP, которая имеет неприятную особенность "слетать" в самый ответственный момент.
А дальше - грузись с неё, у тебя на ней система, остальное не волнует.
Минус: флэшина нужна 512 Мб, лучше гиг.